Том Ям появился в Бирме еще в XVI веке. Местные жители считали, что суп должен быть простым и дешевым, поэтому блюдо сильно отличалось от того, что есть сейчас — тогда добавляли в блюдо все, что было под рукой: мясо курицы, рыбы и даже лягушачьи лапки. Привычный рецепт Том Яма появился лишь в XX веке, когда индийские торговцы добавили в суп креветки и кокосовое молоко.
Буквально название супа состоит из двух тайских слов «том» и «ям». «Том» дословно переводится как «варить» или «кипятить». «Ям» — тайский острый салат. Таким образом, в Таиланде и Лаосе «том ям» означает общее название горячих кисло-острых супов.